境内の南側、石仏や石塔が並ぶ浮田図（ふとでん）に約100株のヒガンバナが鮮やかな花を咲かせます。また国宝の本堂を包み込むように、約120株ものハギが白や紫色の可憐な花を咲かせます。

「萩の寺」としても名高く、数多くのハギが植えられている白毫寺。秋になると、境内へと至る参道の左右両側に、白や紅紫など可憐な色合いの花が咲きこぼれ、訪れる人を優しく迎えます。

境内のフヨウやスイフヨウ約150本が大輪の花を咲かせ、堂宇を清楚に彩ります。また観音堂のそばでは紫色のハギの花が咲きこぼれ、風が吹くたび優しく揺れる様子に心が和みます。

文殊池の東方に約30種のコスモスが植えられ、オーソドックスなものから珍しいものまで、実にさまざまな品種を間近で見ることができます。

「コスモス寺」の愛称で親しまれる般若寺。境内に、約25品種15万株ものコスモスが咲き誇ります。コスモスの花を浮かべた「華水鉢」も可愛いと話題です。